Nueva tecnologías para detectar la fusión de genes abre una nueva área de investigación en cáncer

ANN ARBOR, Michigan.— Un equipo de investigadores en el Centro Integral del Cáncer de la Universidad de Michigan, utilizó nuevas tecnologías que facilitan el conocimiento de la secuencia del genoma humano, ha identificado una serie de genes que se funden cuando canjean sus cromosomas. Se piensa que esta fusión repetida de genes es el mecanismo que hace que se desarrollen ciertos cánceres.

Las fusiones de genes descubiertas podrían servir, algún día, para el diagnóstico del cáncer o como blanco para el desarrollo de futuros medicamentos.

En un nuevo estudio que publica la revista Nature los investigadores identificaron varias fusiones de genes en las células del cáncer de próstata. Algunas de las fusiones se observaron en múltiples líneas de células estudiadas, en tanto que otras fusiones de genes aparecieron sólo una vez. Las fusiones se encontraron en las células de cáncer y no en las células normales.

“Hemos definido una nueva clase de mutaciones en el cáncer de próstata. Se piensa que las fusiones recurrentes son el mecanismo que promueve el cáncer. Pero encontramos asimismo otras fusiones, algunas de las cuales fueron únicas en pacientes individuales. Nuestro próximo paso es entender si éstas desempeñan un papel promotor de la enfermedad”, dijo Azul Chinnaiyan, director del Centro Michigan para Patología Transnacional y académico de la Cátedra S.P. Hicks de Patología en la Escuela de Medicina de la UM.

El equipo de Chinnaiyan fue el primero que ha identificado los ajustes de cromosomas y los genes fusionados en el cáncer de próstata. Ya se sabía antes que las fusiones de genes desempeñan un papel en los cánceres de células de la sangre tales como la leucemia y el linfoma, y en el sarcoma de Ewing.

En el estudio actual los investigadores muestran que las técnicas más novedosas podrían identificar con más rapidez y facilidad estas fusiones de genes.

Los investigadores usaron una técnica llamada secuencia de gene, que involucra la creación de un archivo de todo el ácido ribonucleico en una célula. Las máquinas de secuencia luego operan 24 horas por día durante días leyendo el ARN. Una vez que se completa la secuencia, los investigadores estudian los datos en búsqueda de fusiones de genes.

Éste es un método aún más directo que el usado por el laboratorio de Chinnaiyan cuando identificó por primera vez las fusiones de genes en el cáncer de próstata, un proceso llamado microensayo. El uso de la tecnología de microensayo los investigadores debían saber primero qué es lo que buscaban. Con la secuencia de gen los investigadores pueden encontrar lo que haya allí sin saber antes dónde buscarlo.

“Ahora tenemos la capacidad de usar la tecnología de secuencia de la siguiente generación. Esto amplía el campo en la investigación del cáncer”, dijo Chinnaiyan, un investigador en el Instituto Médico Howard Hughes. Si bien el estudio actual se concentró en el cáncer de próstata, su equipo también busca fusiones de genes en el cáncer de mamas, el de pulmón y el melanoma.

Las conclusiones: Los investigadores probaron una tecnología de secuencia de genes para ver si podrían encontrar las mismas fusiones de genes que se habían encontrado usando otras tecnologías. Además de verificar las fusiones de genes conocidas los investigadores hallaron nuevas fusiones de genes que son comunes entre algunas muestras de tumores. Se identificaron fusiones de genes adicionales en muestras de tumores individuales.

Autores adicionales: Christopher Maher, investigador; Chandan Kumar Sinha, profesora e investigadora de patología; Xuhong Cao, investigador especialista; Shanker Kalyana Sundaram, arquitecto de datos; Bo Han, investigador; Siaojun Ping, Lee Sam, Terrence Barrete, analistas de sistemas, y Nallasivan Panaisamy, profesor investigador asistente de patología.

Financiación: Institutos Nacionales de Salud, Departamento de Defensa, y Red de Investigación de Detección Temprana.

Referencia: Nature, publicado en Internet el 11 de enero, 2009, DOI: 10. 1038/Nature07638

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