ANN ARBOR, Mich.– Científicos de la Universidad de Michigan han avanzado un paso más para algún día poder analizar la composición genética del tumor cancerígeno de cada uno de sus pacientes para determinar el mejor tratamiento a seguir.
Doctores en el Centro Integral del Cáncer de la Universidad de Michigan, trabajando con
Thermo Fisher Scientific, los investigadores han desarrollado y probado programa de secuenciación genética llamado
Mi-ONCOSEQ que completa la secuencia más rápidamente y por menos dinero que las plataformas de secuenciación actuales y se puede utilizar con una amplia gama de tipos de muestras de tumor, incluidas pequeñas biopsias y muestras de tejido archivadas.
En el futuro, esto podría significar que los pacientes no siempre tendrían que someterse a una biopsia nueva para identificar una posible estrategia de tratamiento, como es actualmente necesario.
“Tenemos un montón de experiencia en la Universidad de Michigan en encontrar la manera de aplicar la medicina personalizada a los pacientes con cáncer. Uno de los principales retos que hemos encontrado es que al hacer el análisis es un cuello de botella importante (en el proceso). Nuestro objetivo era encontrar una manera de hacer el proceso más fácil de escalar a un mayor volumen de pacientes para que podamos hacer esto para todos nuestros pacientes “, dijo Scott A. Tomlins, MD, Ph.D., profesor asistente de patología y urología de la Facultad de Medicina de la Universidad de Michigan.
Tomlins es el autor principal de un artículo publicado en la revista Neoplasia que describe la nueva herramienta, llamada “Oncomine Comprehensive Panel.”
Los investigadores cernieron una base de datos de más de 700.000 muestras de tumores e identificaron las variantes genéticas más comunes en los distintos tipos de cáncer.
Luego filtraron la lista para incluir aquellas variantes asociadas con medicamentos aprobados por la Administración de Alimentos y Drogas de Estados Unidos (FDA, por sus siglas en inglés), aquellas que hagan referencia en guías clínicas, o asociadas con las terapias de investigación en ensayos clínicos.
Los investigadores evaluaron el panel en más de 300 muestras de tejidos, incluyendo más de 100 que también había sido probados por la prueba genómica clínica habitual. El ensayo confirmó los cambios genéticos previamente identificados. También identificó variantes relevantes adicionales en las muestras de tejido.
“Uno de los desafíos reales de la medicina personalizada es la idea de que vamos a encontrar un objetivo verdaderamente accionable para cada paciente. Lo que estamos encontrando es que no siempre es el caso,” dijo Tomlins puntualizando que esto es aún más pronunciado para los pacientes que han pasado por varias líneas de tratamiento estándar sin éxito. “El futuro de la medicina personalizada significará saber temprano en el curso de la enfermedad lo que impulsa la variante genética del tumor de un paciente. Entonces seríamos capaces de ponerlos en el mejor tratamiento tan pronto como sea posible.
“El resultado de este estudio es que ahora podemos ayudar a los investigadores clínicos a superar los retos que habían impedido el uso rutinario de secuenciación de próxima generación para identificar y priorizar las variantes genéticas relevantes”, dijo el coautor del estudio, Dan Rodas, Ph.D., vicepresidente presidente de estrategia de oncología en Thermo Fisher Scientific. “Como hemos demostrado, ahora es posible aplicar un enfoque de secuenciación altamente escalable, orientado a detectar variantes de cáncer pertinentes, abriendo la puerta a aplicaciones clínicas de rutina en un futuro próximo.”
Los pacientes interesados en aprender más acerca de las oportunidades de secuenciación genética o ensayos clínicos de la Universidad de Michigan puede llamar al 800-865-1125.
Autores adicionales: De U-M: Daniel H. Hovelson, Andrew S. McDaniel, Andi K. Cani, Venkata Yadati, Anmol Amin, Javed Siddiqui, Bryan L. Betz, Kathleen A. Cooney, Felix Y. Feng, Michael H. Roh, Chia-Jen Liu, David G. Beer, Arul M. Chinnaiyan, Daniel R. Rhodes. De Thermo Fisher Scientific: Bryan Johnson, Kate Rhodes, Paul D. Williams, Santhoshi Bandla, Geoffrey Bien, Paul Choppa, Fiona Hyland, Rajesh Gottimukkala, Guoying Liu, Manimozhi Manivannan, Jeoffrey Schageman, Efren Ballesteros-Vallagrana, Peter Wyngaard, Seth Sadis. De la Universidad de Salud y Ciencias de Oregon: Catherine S. Grasso, Michael J. Quist. From Thomas Jefferson University: Karen E. Knudsen. Del Centro de Investigación de Cáncer Fred Hutchinson: Peter S. Nelson.
Financiación: Fundación Evans para la Investigación del Cáncer de Próstata; Institutos Nacionales de Salud subvenciones R01 CA183857, CA181605 R01, R01 CA 159945, R01 CA154365, UM1 HG006508; Departamento de Defensa de EE.UU., Life Technologies / Thermo Fisher Scientific; Fundación Stand Up to Cancer-Prostate Foundation; A. Alfred Taubman Medical Research Institute
Aviso: La Universidad de Michigan ha emitido una patente sobre la detección de fusiones de genes ETS en el cáncer de próstata, en la que Chinnaiyan y Tomlins figuran como co-inventores. La Universidad de Michigan licenció el campo de diagnóstico de utilidad para Gen-Probe Inc., que ha sublicenciado algunos derechos a Ventana / Roche. Tomlins sirve como consultor y ha recibido honorarios de Ventana / Roche. Tomlins tiene un acuerdo de investigación patrocinado con Thermo Fisher Scientific, que apoyó este trabajo
Referencia: Neoplasia, vol. 17, No. 4, pp 385-399,
doi:. 10.1016 / j.neo.2015.03.004
